卡拉瓦乔是15世纪末16世纪初意大利最伟大的艺术家，他以前所未有的朴实无华的作风为15-16世纪文艺复兴时期的人文主义绘画向17世纪现实主义绘画的转型起到了关键而重要的作用，对同时代的西班牙、法国、荷兰以及19世纪的现实主义美术思潮都有着深远影响。其后的许多名家如伦勃朗和委拉斯贵支都对他崇拜有加，在他们的作品中都可以看到“卡拉瓦乔风格”的影响。

1609年，在那不勒斯，一群不明来历的人袭击了他。最初，罗马传闻“最著名的艺术家”卡拉瓦乔丧生，但后来又获悉他还活着，但面部受了重伤。他画了一幅《带着施洗约翰头颅的莎乐美》，画中的大盘子里正是卡拉瓦乔自己的头，画被送给德·维格纳科特乞求宽恕。可能同时他还画了《手提歌利亚头颅的大卫》，画中年轻的大卫以奇怪的悲伤神情注视巨人的带伤的头颅，这颗头颅依旧是卡拉瓦乔的头。这幅画他可能送给红衣主教的侄子希皮奥内·博尔盖塞，这个狂热的艺术爱好者掌握着赦免大权。

1610年夏天，卡拉瓦乔乘船朝北接受赦免状，赦免状似乎归功于他那些有权势的罗马朋友。此行他带了给红衣主教希皮奥内作礼物的最后三幅画。接下来发生的一切众说纷纭，莫衷一是。不加渲染的事实是，7月28日一份从罗马发到乌尔比诺的公爵宅邸的匿名私人新闻说卡拉瓦乔死了。3天以后另一份私人新闻说他死于热病。这些是最早的死亡简报，后来有更加详细的报道。但一直没有发现尸体。卡拉瓦乔的一个诗人朋友把7月18日当作他的忌日，最近有研究者声称发现了一个讣告，讣告显示卡拉瓦乔那一天在托斯卡尼区格罗塞图附近的埃尔科莱港死于热病。

这位死于1610年的伟大艺术家，其死因及遗体的下落至今仍扑朔迷离。六位卡拉瓦乔的疑似后代希望通过DNA测试揭开卡拉瓦乔死亡之谜。拉文纳和博洛尼亚大学人类学和文化遗产保护学系，几个月以来一直在挖掘被掩埋的尸体，希望能够做一次迟来的验尸。这支由意大利人类学家组成的队伍认为卡拉瓦乔的遗体可能在托斯卡纳区(意大利行政区名)的一个地窖中，与其他尸体混在一起。　　

学者们对卡拉瓦乔的死提出过许多看法，最普遍的是说法说是卡拉瓦乔由于宗教原因遭到暗杀，或者是在托斯卡纳的海滩上死于疟疾。然而，2001年，一位意大利的研究员声称发现了卡拉瓦乔的死亡证明书，依其陈述，卡拉瓦乔是在医院去世的。2010年3月底，他们来到了卡拉瓦乔的生长小镇，对他的疑似子孙进行考察。由于卡拉瓦乔死后无嗣，这支队伍找到了与他血缘最近的子孙，以便寻找配对的DNA。

负责此次调查的Giorgio Grupponi 教授说，“我们为在这里的姓卡拉瓦乔的个人进行了DNA测试，相信这里面会有人与这位伟大的艺术家有遗传学上的联系。接着，我们会进一步将其与这些遗体的DNA进行比对。预测结果产生的时间和可能性很难，如果够幸运，希望能在两三个月内完成任务。”“如果我的DNA与卡拉瓦乔的DNA配对成功的话，对我来说，这将是一个天大的惊喜。”接受DNA测试的Stefano Merisio这样说，“我从未想过，我不敢相信这是真的，它无疑会使我很高兴。但对于它将为我的生活或者名声带来多大改变，我并不抱太大希望。”